LUMICA iluminará el genoma de un calamar de las profundidades marinas

Palma, miércoles 4 de noviembre de 2026. El proyecto LUMICA, coordinado por la Universidad de las Islas Baleares (UIB) con la participación del Centro Oceanográfico de las Illes Balears del Instituto Español de Oceanografía (IEO-CSIC), tiene como objetivo obtener un genoma de referencia de alta calidad de Histioteuthis reversa, un calamar mesopelágico ampliamente distribuido en aguas templadas del hemisferio norte, pero todavía poco conocido desde el punto de vista biológico y genético.

El océano profundo constituye el bioma más extenso del planeta y, al mismo tiempo, uno de los menos estudiados. En estos ambientes, caracterizados por la falta de luz, la estabilidad de las condiciones ambientales y la escasez de nutrientes, los cefalópodos desempeñan un papel ecológico esencial: actúan como depredadores y presas y conectan distintos niveles de las redes tróficas marinas. A pesar de esta importancia, todavía se conoce poco sobre los mecanismos que les permiten vivir en condiciones tan particulares y sobre su capacidad de responder a alteraciones ambientales como el calentamiento oceánico.

Un mapa genético para entender la vida en las profundidades

Un genoma de referencia funciona como un gran mapa de las instrucciones biológicas de una especie. Disponer de este recurso permite identificar sus genes, estudiar cómo se organizan y compararlos con los de otros organismos. En el caso de Histioteuthis reversa, el proyecto explorará mecanismos genéticos potencialmente relacionados con la vida en aguas profundas, entre ellos la regulación de la expresión génica, las vías metabólicas y la arquitectura genómica compleja propia de los cefalópodos.

Los genomas de los cefalópodos pueden ser grandes y estructuralmente complejos, con una elevada proporción de secuencias repetitivas, expansiones de familias génicas y reorganizaciones cromosómicas. Para resolver esta complejidad, LUMICA combinará tecnologías de secuenciación de lecturas largas, lecturas cortas y datos de proximidad cromosómica. La integración de estas tecnologías permitirá ordenar y orientar las secuencias obtenidas con el objetivo de conseguir un ensamblaje a escala cromosómica.

Muestras obtenidas en las aguas de las Pitiusas

Las muestras biológicas de la especie se obtuvieron durante la campaña científica MEDITS en el área de las Islas Baleares. Los ejemplares se procesaron a bordo y se preservaron de inmediato en nitrógeno líquido, antes de almacenarlos a –80 °C. De cada individuo se recogieron muestras de músculo, hepatopáncreas y gónada, que permitirán extraer ADN de alto peso molecular y ARN para generar y anotar el genoma.

Una colaboración entre genómica y ecología marina

El proyecto integra dos equipos con perfiles complementarios. El grupo de Genética Humana y Evolutiva (HEGEN) de la UIB liderará las actividades relacionadas con el diseño experimental, el procesamiento de los datos de secuenciación, el ensamblaje del genoma y los análisis bioinformáticos. Por su parte, el grupo de Ecosistemas Bentónicos y Recursos Demersales (ECOBRED) del IEO-CSIC aportará su experiencia en la biología, ecología y ciclo vital de los cefalópodos de profundidad, así como en la recolección de las muestras y la interpretación ecológica de los resultados.

«La investigación forma parte de la Iniciativa Catalana per a l’Earth BioGenome Project (CBP) cuyo propósito es avanzar en el mapa genómico de la biodiversidad marina. Combinar la experiencia del IEO en el medio marino con la capacidad de análisis genómico de la UIB es un salto cualitativo en nuestra investigación sobre la fauna de profundidad y refuerza nuestro compromiso con la catalogación y protección de la biodiversidad marina», señala Antoni Quetglas, investigador principal del proyecto en el IEO.

«Con LUMICA queremos iluminar una parte todavía muy desconocida de la biodiversidad marina. Obtener un genoma de referencia de Histioteuthis reversa nos permitirá estudiar con mucho más detalle cómo se organiza su genoma y explorar las bases genéticas que pueden haber contribuido a su adaptación a la vida en las profundidades oceánicas», señala Sergio Ramírez-Amaro, investigador de la UIB y coordinador del proyecto.

Sobre el proyecto

LUMICA, «Luz en la oscuridad: descifrando el genoma de un calamar de las profundidades marinas, Histioteuthis reversa«, es un proyecto coordinado entre la Universidad de las Islas Baleares y el Instituto Español de Oceanografía (IEO-CSIC). La propuesta tiene una duración prevista de un año y ha sido financiada en el marco de la quinta convocatoria de ayudas para la investigación en biogenoma del Institut d’Estudis Catalans, con la referencia IEC-BG5-2026-12.

El Instituto Español de Oceanografía (IEO) es un Centro Nacional del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), dependiente del Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades, dedicado a la investigación en ciencias del mar, especialmente en lo relacionado con el conocimiento científico de los océanos, la sostenibilidad de los recursos pesqueros y el medio ambiente marino. El IEO representa a España en la mayoría de los foros científicos y tecnológicos internacionales relacionados con el mar y sus recursos. Cuenta con nueve centros oceanográficos costeros, cinco plantas de experimentación de cultivos marinos, 12 estaciones mareográficas, una estación receptora de imágenes de satélites y una flota compuesta por cinco buques oceanográficos, entre los que destaca el Ramón Margalef y el Ángeles Alvariño. El Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) y, en particular, el Programa Operativo de I+D+i por y para el Servicio de las Empresas (Fondo Tecnológico), participa en la cofinanciación de los buques Ramón Margalef, Ángeles Alvariño y Francisco de Paula Navarro, así como en el Vehículo de Observación Remota (ROV) Liropus 2000.