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El Centro Oceanográfico de Baleares (COB), dispone de buques de investigación oceanográfica, de diferentes envergaduras, y de equipamiento científico-tecnológico que utilizan los grupos de investigación en hábitats y recursos marinos vivos explotados, en sus campañas oceanográficas.

Desde hace más de 30 años, el centro tiene adscrito el buque oceanográfico costero Odón de Buen, que próximamente será re-emplazado por el Francisco de Paula Navarro, de mayor porte y actualmente en remodelación, y que permitirá ampliar las prestaciones del COB, mejorar su instrumental científico-técnico y dar mayor servicio a los grupos de investigación antes mencionados. Éstos aplican tanto técnicas directas, de toma de datos ambientales y recogida de muestras hidrográficas y de organismos planctónicos y bentónicos, como métodos indirectos, basados en instrumentación acústica y equipos de observación visual directa.

Además, el COB dispone de una lancha semirrígida, L'Aup, de 5 metros de envergadura y un motor de 50 CV, y de la embarcación Enfú recientemente adquirida, que permiten estudios en zonas cercanas a la costa y resultan muy eficaces al grupo de investigación dedicado a las Áreas Marinas Protegidas.